Mülkiyeti hazineye ait olan bina, 1794 yılında jandarma binası olarak kullanılmak üzere iki katlı inşa edilmiş olup binanın alt katı daha sonra hapishaneye dönüştürülmüştür.1921-1922 yunan işgali sırasında tamamen yakılarak enkaz haline gelen yapı, Kurtuluş Savaşı sonrasında temelleri üzerine yeniden iki katlı inşa edilerek üst katı adliye alt katı ise hapishaneolarak kullanılmıştır.
Altı koğuş, dört oda, üç atölye, üç ambar, üç münferit hücreve bir hamamdan oluşan yapının biri hükümlere ve biri de sanıklara mahsus ikiavlusu bulunmaktadır.
1995 yılına kadar hapishane olarak kullanılan bina, adliyeve hapishanenin başka bir yere taşınmasından sonra müze binası olarak kullanılmak üzere, 1996 yılında Kültür ve Turizm Bakanlığı’na devredilmiştir.
1997 yılında binanın restorasyon çalışmalarına başlanılmış olup çalışmaların 2006 yılı sonunda tamamlanmasıyla 20 Nisan 2007 tarihinde,Söğüt Müze Müdürlüğü’ne bağlı bir birim olarak Bilecik Müzesi adıyla hizmete açılmış olup 07.04.2010 tarihinde Bilecik Müzesi Müdürlüğü olarak hizmetvermeye başlamıştır.