İl Merkezimizde bulunan Kırşehir Müzesinin ilk kuruluş çalışmasına 1936 yılında başlanmıştır. Yeni müzelerin kurulmaya çalışıldığı Cumhuriyet Döneminde tarihi eserler ilkin, Kırşehir'de halkın "Kale" olarak adlandırdığı Kale Höyük üzerinde yer alan Alaaddin Camii'nde toplanmıştır. 1975' te Kırşehir Valiliği'nce eski eserlerin korunması ve müze oluşturulması için "eski eser komisyonu" kurulmuş; 1980 yılında ise Kırşehir Müze Müdürlüğü tesis edilmiştir ve ilk eser (sikke) envanter kaydı 1983 yılında yapılmıştır. 1985’te şehir merkezindeki İl Kültür ve Turizm Müdürlüğü binasında 100 m² lik bir mekânda o yıla dek toplanan eserler sergilenmeye başlanmış ve 20 m² bir de depo oluşturulmuştur. 1986 yılında Kırşehir’in Kaman İlçesi Çağırkan Kasabasında bulunan Kalehöyükte arkeolojik bir kazının başlamasıyla müzenin gelişimi hızlanmış ve aynı yıl ilk arkeolojik eser müze envanterine alınmıştır.1993 yılında müze koleksiyonundaki eserler Kırşehir Kültür Merkezi'ndeki depolara konmuştur.

Bu aşamalardan sonra Kırşehir Müzesi 1997 yılında, İl Kültür ve Turizm Müdürlüğü binası içerisindeki Kültür Merkezinin bir bölümü olan ve asma katla birlikte iki kattan oluşan Güzel Sanatlar Galerisinde hizmet vermeye başlamıştır. 2018 yılı Kasım ayında ise şu an hizmet verdiği 15.000 m lik bir alanı kapsayan ve bodrumla birlikte üç kattan oluşan yeni müze binasına taşınılmıştır. Ancak müzenin teşhiri henüz yapılmadığı için ziyarete kapalıdır, bu binada idari olarak hizmet vermektedir. Eserler ise depolarda muhafaza edilmektedir. Kırşehir Müzesi arkeolojik, etnografik ve sikke seksiyonundan eserlerin bulunduğu genel bir müzedir. Envantere kayıtlı yaklaşık 6000 sikke, 1200 etnografik ve 1110 arkeolojik eseri bulunmaktadır.